第一百四十三章 生化分析器
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分子尺度的細(xì)胞模型,是各所大學(xué)的生物實(shí)驗(yàn)室一直努力建立和完善的東西。 二百年前的二十一世紀(jì),大約2034年前后的時(shí)候,神州大地的大學(xué)與研究生,擁有的分子級(jí)別生物模型的數(shù)量,是〇。 生物力學(xué)實(shí)驗(yàn)室的存在歷史不超過七十年。即使是在大神州,細(xì)胞模型做得最早和最豐富的,也絕非生物力學(xué)實(shí)驗(yàn)室。 不過,他們實(shí)驗(yàn)室的海鞘模型,嶄嶄新,足夠精細(xì)。因?yàn)槟贻p,所以先進(jìn)。不僅僅是分子尺度的細(xì)胞模型,而且是分子級(jí)別的生物體整體模型。 模型構(gòu)建者蘭澤吹噓,他可以利用附帶的計(jì)算工具,對(duì)海鞘細(xì)胞進(jìn)行任意的功能修改。只要用生物化學(xué)規(guī)則計(jì)算出相應(yīng)的dna序列嵌入到原來的染色體中,就可以達(dá)到修改可遺傳的效果。 現(xiàn)有的做dna設(shè)計(jì)的實(shí)驗(yàn)室,做到的事情,也就是利用基因庫(kù)拼裝新細(xì)胞的dna。做得好的幾家都是基因庫(kù)積累比較強(qiáng)大的。 “你這個(gè)厲害了嘛!”仙女這么說來著。 老羅教授專門召集實(shí)驗(yàn)室全體人員,包括忙的、閑的、打雜的、日常進(jìn)來溜達(dá)的,開了個(gè)會(huì)。 他對(duì)全世界宣布,本實(shí)驗(yàn)室的海鞘數(shù)學(xué)模型暨海鞘數(shù)據(jù)動(dòng)態(tài)庫(kù)可以用了。歡迎同行來,要么膜拜要么砸場(chǎng)子。 這個(gè)會(huì)開得,門都不關(guān)。 仙女等散會(huì)才進(jìn)來找蘭澤。 蘭澤身邊正圍著一幫學(xué)弟學(xué)妹,個(gè)個(gè)眼中閃著膜拜的星光。以前在體育總館玩模擬器,他經(jīng)常被膜拜,所以挺習(xí)慣的。 “還可以吧?!碧m澤不帶謙虛的。 “可以修改細(xì)胞的話,如果我們不知道功能對(duì)應(yīng)的基因是什么,怎么改呢?”勤學(xué)好問的混實(shí)驗(yàn)室的大四小師妹問。 “算嘛。” “算什么?”師妹一臉萌萌噠。 “用功能蛋白質(zhì)計(jì)算dna呀?!碧m澤理所當(dāng)然地說。 “哎?可以編程了?”仙女恍然大悟。 蘭澤沉思半晌,“你這個(gè)想法好啊?!?/br> 仙女一說,他才意識(shí)到,利用分子間作用力反推計(jì)算dna序列這件事,根本上就是編程嘛! 用電腦玩編程,他熟得很。雖然dna序列他沒玩過,但道理大致相通,規(guī)則略有不同而已。至于同一條染色體上兩端靠共振通訊,dna大長(zhǎng)鏈各種擰麻花式調(diào)節(jié)功能,這些生物大分子的特色,正是和電腦不完全一樣,才有意思。不是嗎? 他們實(shí)驗(yàn)室的樓上,以及大東研發(fā)城的研究所,都有人在做dna編程設(shè)計(jì)。不少實(shí)驗(yàn)室可以在現(xiàn)有真核微生物的基礎(chǔ)上,做一些特殊功能的修改。至于病毒設(shè)計(jì),已經(jīng)有少量的成熟商業(yè)應(yīng)用了。 dna和氨基酸的對(duì)照表,早在二十世紀(jì)就被人摸清楚了。光靠這個(gè)完全沒法設(shè)計(jì)出生物來。正如知道鐵是鐵,離發(fā)明訂書機(jī)還差著八百里呢。 基因庫(kù)的大部分內(nèi)容,實(shí)際上是關(guān)于各種條件下,細(xì)胞內(nèi)的活動(dòng)如何控制、如何cao作的。以所謂“cao縱元”為單位。大部分cao縱元的部件,并不按順序排列在一起。有時(shí)候甚至可以跨越好幾條染色體。正是因?yàn)檫@樣的復(fù)雜性,基因庫(kù)中每一項(xiàng)新的功能單元,分析需要十分細(xì)致?;驇?kù)在歷史上的積累是十分緩慢的。 沒有基因庫(kù),dna編程就沒有零件。 蘭澤忽然覺得,他可以再多做一點(diǎn)東西。比如說,寫個(gè)生化分析器代替基因庫(kù)? 計(jì)算一下生命相關(guān)的各種調(diào)控方式,各種功能性大分子,應(yīng)該是可以做到的吧? 想到了,他就問道: “你們幾個(gè),有沒有時(shí)間,幫我做幾個(gè)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)?” “蘭師兄,要做什么實(shí)驗(yàn)?”一群師弟妹踴躍撲了上來,“我來,我有空。” “別急,實(shí)驗(yàn)夠大家分的?!碧m澤從容地說。 “我能幫上什么忙嗎?”仙女笑著問。 蘭澤想了想:“我想看看現(xiàn)有的生化分析算法長(zhǎng)什么樣?!?/br> 仙女替他篩選了一些常用而又不涉密級(jí)的生化分析算法。 蘭澤回到宿舍里收到后,躺在床上慢慢看完,時(shí)間就挺晚的了。 他發(fā)現(xiàn)一件事,這些算法挺陳舊的。 物理學(xué)和數(shù)學(xué)并不是幾百年沒有進(jìn)展的學(xué)科。但是這些算法,都建立在上百年前人類對(duì)世界認(rèn)知的基礎(chǔ)上。 作為一個(gè)自我感覺數(shù)學(xué)不錯(cuò)的人,蘭澤認(rèn)為,生化分析算法,他應(yīng)該自己重寫一遍。 現(xiàn)有的算法,并不太適合分析生物大分子。尤其是大型的、聚合在一起的肽鏈、核糖鏈、多肽與核糖結(jié)合在一起的復(fù)雜長(zhǎng)鏈,往往具有打了結(jié)又繞在一起的結(jié)構(gòu)——這些結(jié)構(gòu)是很多生物功能的基礎(chǔ)。但是現(xiàn)有的算法,有的處理方式和算術(shù)沒什么本質(zhì)區(qū)別,有的則根本不顧這些復(fù)雜結(jié)構(gòu)。 原因很簡(jiǎn)單:術(shù)業(yè)有專攻。數(shù)學(xué)、物理和化學(xué)本來就是不同的領(lǐng)域。 主流算法久經(jīng)考驗(yàn),一般情況下已經(jīng)足夠簡(jiǎn)便好用,也用不著太先進(jìn)。但用來處理生物微觀活動(dòng),這些算法的效率和精度都不夠。 而被國(guó)家研究部門珍藏的,有密級(jí)的生化分析算法,會(huì)是什么樣,蘭澤暫時(shí)也看不到。 他琢磨完了這些現(xiàn)有的算法,直接合上眼睛,打算睡覺來著。眼角好像閃過一抹藍(lán)光。 于是他舉起手環(huán)看了一眼,發(fā)現(xiàn)有延時(shí)消息。 他設(shè)置過的,張荷大學(xué)姐聯(lián)絡(luò),手環(huán)閃藍(lán)光。 “小朋友,想不想去游泳?”張大學(xué)姐的聲音特別有質(zhì)感。不清脆,但是說不出的好聽。 這條消息,按照大學(xué)姐的設(shè)置,本該在他醒來以后,才震動(dòng)提醒他查看手環(huán),現(xiàn)在提前查看到了。 “想?!碧m澤輕輕地回答了一個(gè)字。 “哎?幾點(diǎn)了還不睡?” “睡不著?!碧m澤眼睛都閉上了。閉著眼說瞎話。 “睡不著,我們聊會(huì)兒天?” “不要?!?/br> “嗯?” “得了。什么時(shí)候游泳?”蘭澤迷迷糊糊地問。 “游泳啊……” “快說時(shí)間?!碧m澤困得不行,又特別想去游泳。不管能不能游,哪怕看看水都是好的。 “你……明天……天氣……站點(diǎn)……風(fēng)……”蘭澤完全沒有聽清楚張荷到底說了什么。